- Oggetto:
- Oggetto:
Tecniche di diagnosi e analisi molecolari 2
- Oggetto:
Anno accademico 2011/2012
- Codice dell'attività didattica
- AGR0134
- Docente
- Davide Carmelo SPADARO (Affidamento interno)
- Insegnamento integrato
- Tecniche di laboratorio integrate (AGR0134)
- Crediti/Valenza
- 4
- SSD dell'attività didattica
- AGR/12 - patologia vegetale
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Acquisire le basi teoriche e pratiche di alcune tra le principali tecniche molecolari per la diagnosi in campo agrario. Possedere una solida preparazione di base indispensabile per proseguire gli studi universitari.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Il corso si propone di fornire conoscenze teoriche e pratiche sulle principali tecniche di biologia molecolare applicate al campo agrario.
- Oggetto:
Programma
Introduzione
Applicazioni: funghi e batteri fitopatogeni, patogeni umani, OGM, resistenza a fungicidi…
Tecniche per la diagnosi di funghi e batteri fitopatogeni
Isolamento di funghi
Preparazione di substrati
Identificazione al microscopio di funghi fitopatogeni
Estrazione di DNA da funghi (kit, chimica, KingFisher, QiaCube)
PCR classica
Elettroforesi su gel di agarosio
RAPD e AFLP
BIOINFORMATICA: Disegno di primer con primer 3, Blast, Allineamento di sequenze
Costruzione di alberi filogenetici
Analisi di sequenze (DNA/cDNA, presenza di introni, SNP, aplotipi. INDEL)
Analisi di proteine
Estrazione di RNA
Retrotrascrizione di RNA a cDNA
Espressione genica
Real time PCR
Multiplex real time PCR con 4 canali
Individuazione di SNPs: high resolution melting
Studio dei meccanismi coinvolti nella lotta biologica: in vitro, in vivo
Clonaggio di geni (glucanasi, chitinasi, proteasi)
Simulazione di clonaggio di geni in silico
Sequenziamento di genomi (next-gen sequencing)
Sviluppo di nanosensori
Sviluppo di microarray
Sviluppo di lab on a chip
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Il docente fornirà materiale didattico inerente gli argomenti trattati a lezione e durante le esercitazioni pratiche.
- Oggetto: