- Tipologia
- Tesi sperimentale
- Argomento
- TIROCINIO 4CFU: Analisi BSA-seq (Bulk Segregant Snalysis sequencing) per identificare loci associati alla maschio-sterilità in carciofo
- Disponibile dal
- 03/11/2020
- Presso
- Genetica agraria - DISAFA
- Altre informazioni
- Requisiti:- avere superato l'insegnamento di Bioinformatica e statisticaInformazioni- Strumenti utilizzati: bash scripting, R scripting (pipeline già esistenti)- il tirocinio potrà essere svolto interamente in remoto (riunioni via webex e lavoro su server Unito)Materiali bibliografici-Michelmore et. al (1991): Bulk Segregant Analysis(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC52814/)- Klein et al (2018): BSA-seqhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6222591/- Zayas et al (2019): paper che descrive i materiali e il disegno sperimentale (analisi BSA)
(https://link.springer.com/article/10.1007/s10681-019-2531-1)
- Acquadro et al (2020): il genoma di riferimento che si utilizzerà per l'analisi BSA-seq:(https://www.g3journal.org/content/10/10/3557)- A partire dai materiali di Zayas et al (2019) sono stati eseguiti e sono disponibili i sequenziamenti Illumina - Stato
- Assegnata
Rivolgersi a:
- Docente
- Alberto Acquadro
- alberto.acquadro@unito.it
- Telefono
- 0116708813
